1.中国民航确立“十一五”发展规划
　　2006年9月28日，民航总局正式印发了《中国民用航空发展第十一个五年规划》，提出了民航“十一五”发展的指导思想和基本原则。《规划》明确了我国民航“十一五”期间的发展目标：航空运输快速增长，质量有较大改善；通用航空总量扩大，结构趋于优化；基础设施建设得到加强，保障能力显著提高；体制和法制基本完善，行业文化基本形成。到“十一五”期末，行业综合实力全面增强，在国家综合交通中的作用更加突出，对世界民航的影响进一步扩大，基本适应国民经济和社会发展需要。
　　《规划》共分为8章23节，在明确我国民航“十一五”发展指导原则和发展目标的基础上，从促进民航事业全面发展、大力提高航空安全水平、加快建设民用机场体系、建设现代化空管系统、实施科教兴业和人才强业战略、深化改革开放6个方面描绘了我国民航未来5年的发展蓝图。同时，《规划》中采用专栏的形式统计了民航“十五”计划主要指标完成情况，制定了“十一五”时期民航发展主要指标，介绍了航空安全、机场建设、空管建设、教育培训、科技建设等民航“十一五”期间的重点建设工程。
　　2.民航圆满完成中非论坛保障任务
　　2006年11月3日至5日,中非合作论坛北京峰会暨第三届部长级会议在北京成功举办，民航各有关单位圆满完成对此次论坛的航空运输保障工作。此次航空运输保障规格高、机场迎送仪式规模大，论坛期间，民航承担了参加论坛与会国家领导人和部长级官员的全部专机、包机和乘坐航班的航空运输保障任务，并积极配合有关部门在首都机场举行迎送仪式。在民航总局的统一部署和指挥下，在民航各单位与外交部、公安部等有关部门团结协作，共保障会议专包机48架次、航班110架次，迎送参会国家元首和政府首脑、部长及其随行人员2584人次、行李6063件，未发生任何差错。
　　3.中国民航安全审计试点工作正式启动
　　2006年10月10日，中国民航安全审计（China Aviation Safety Audit Program，简称CASAP）试点工作在深圳正式启动。作为此次安全审计的试点单位，深圳航空有限责任公司、深圳机场股份有限公司、深圳航管站在为期10天的时间里，接受了民航总局3个安全审计组的安全审计。
　　面对民航体制改革后的新局面及行业持续快速发展的现状，为依法实施更加有效的安全监管，促进企业建立完善的安全管理体系和运行机制，进一步提高行业的安全水平，民航总局决定借鉴国际民航的先进做法，对航空公司、机场、空管等单位实施安全审计。 　 4.国内航班提高赔偿责任限额
　　经国务院批准，从2006年3月28日起，《国内航空运输承运人赔偿责任限额规定》正式施行，承运人对国内航空运输中的旅客、旅客随身携带物品、托运行李以及货主的货物损害的赔偿责任限额由此大幅提高。
　　相对旧的暂行规定，新《规定》既适用于国内民用航空运输中发生的旅客身体损害赔偿，还对旅客随身携带物品、托运行李和运输货物的赔偿责任限额作出了规定。规定同时明确，责任限额今后的调整由民航总局制定，报国务院批准后公布执行。从新《规定》实施之日起，1989年发布、1993年修订的《国内航空运输旅客身体损害赔偿暂行规定》同时废止。
　　5.两岸客运包机实现节日化
　　从2006年6月14日起，两岸客运包机节日化框架性安排正式实施。根据安排，节日包机指在清明、端午、中秋、春节四个节日期间的两岸包机，相关安排比照2006年两岸春节包机作业方式进行。在两岸客运包机节日化框架下，2006年9月29日至10月8日期间，两岸12家航空公司共执行48个航班，运送旅客9202人次，圆满完成了2006年两岸中秋包机飞行。
　　6.国内大部分机场间航线航班经营放开
　　2006年3月20日，《中国民用航空国内航线航班经营许可规定》施行。该规定改进了国内航线航班管理办法，下放了区内航线管理权限，国内大部分机场之间的航线航班经营放开，由航空公司自行安排，按登记和核准两种方式实行民航总局和地区管理局两级分类管理，并建立了评审委员会评审国内航线航班许可机制。但一些资源紧张的机场、繁忙机场、飞行流量较大的机场以及在飞行安全方面有特殊要求的机场，其航线航班仍须民航总局核准。
　　与原来的《国内航线和航班经营管理规定》相比，新规定放宽了经营许可的管理，简化了经营许可程序，明确了航线经营许可的条件，充分体现了民主和公开的原则，加强了事后监督管理条款，重新划分了管理权限，完善了法律责任。此规定的出台，旨在鼓励和引导企业在安全、服务、诚信等方面展开竞争，扩大市场份额，通过优胜劣汰转变行业增长方式和提升运营品质。
　　7.国内民航电子客票使用率超过80％
　　从2006年6月1日起，全国试行由国家税务总局统一监制的航空运输电子客票行程单作为旅客购买电子客票的付款、报销凭证，试行期为两年。各航空公司自行设计使用的电子客票报销凭证即时废止。困扰民航电子客票发展多年的报销凭证问题因此获得解决，大大方便了旅客乘飞机旅行。
　　由于大力推行电子客票，解决了电子客票报销凭证等问题，目前国内民航使用电子客票的比例已超过80％，使用国际航协BSP电子客票已逾90％，中国民航成为国际航协在全球推广“简化商务”的标杆。
　　8.中国民航航线网络连通五大洲
　　2006年12月10日，中国国际航空公司开通了北京经停西班牙首都马德里至巴西圣保罗航线，从而标志着中国与南美洲第一条空中航线开通。随后中国南方航空公司于12月30日开通了北京经阿联酋迪拜至非洲尼日利亚的拉各斯航线。这是中国民航于1992年停飞北京至埃塞俄比亚首都亚的斯亚贝巴航线之后再次开通至非洲国家的航线。
　　国内第一条至南美洲航线的开通以及复航非洲，使中国民航的航线网络连通了全球五大洲。
　　9.国航与国泰进行股权置换
　　2006年6月9日，中国国际航空股份有限公司、国泰航空股份有限公司、中航兴业股份有限公司、中信泰富股份有限公司、太古股份有限公司董事会在香港签署协议，重组其持股结构。根据此次重组协议，国航向中信泰富及太古公司以每股13.5港币的价格收购国泰10.16％的股份，总计金额约为5.48亿港币，此举使国航以及旗下的中航兴业总共持有了国泰航空17.5％的股份。其次，国泰同意以每股3.45港币的价格现金认购11.79亿股国航新H股，总计价格约为41亿港币，从而使其所持有的国航股份由10％增加至20％。再次，国泰航空以82.22亿港币收购其尚未持有的82.21％的港龙航空股份，港龙航空成为国泰航空的全资子公司，在国泰航空的管理下以自身的品牌继续营运。太古和中信泰富也继续减少各自持有的国泰航空股份至40％及17.5％，但太古仍保留扩大后的国泰集团的主要股东地位。8月22日，中国国际航空股份有限公司、国泰航空有限公司、中航兴业有限公司、中信泰富有限公司的股东投票通过了国泰航空与国航之间的持股结构，以及港龙航空有限公司成为国泰航空公司全资附属公司这两项整合持股建议。
　　10.中国民用机场协会、中国民用航空维修协会成立
　　2006年8月25日，中国民用机场协会第一届全国代表大会第一次会议在北京召开，大会审议并通过了《中国民用机场协会章程》、《协会会费管理规定》、《协会会徽》和相关文件，选举产生了以首都机场集团公司总经理李培英为理事长的第一届理事会。之后，该协会完成所有相关注册手续，并投入正常运作。中国民用机场协会由首都机场集团公司、上海机场（集团）有限公司、广东省机场管理集团、四川省机场集团有限公司、陕西省机场管理集团公司、辽宁省机场管理集团公司发起，全国共有106个机场参加。
　　2006年11月，由21家民航单位发起的中国民用航空维修协会在北京召开了首届会员大会，并宣告成立。
　　连同2005年成立的中国航空运输协会，多家行业协会组建，重构了政府、行业协会与企业的关系，将在市场经济条件下形成一种新型的治理秩序，提高政府管理部门和整个行业层面联系的紧密程度。